上海市儿童医院/上海交通大学医学院附属儿童医院普外科是由我国著名小儿外科创始人马安权教授于1954年创立、国内最早建立的小儿外科专业。经过70载的发展，目前已发展成为包括新生儿、肝胆、肛肠、肿瘤、微创等各专业、在国内有很高学术影响力的学科。目前，普外科拥有床位72张，年门急诊量约50000余人次，年手术量约4000余人次；现有外科医生24名，专职科研人员1名；其中博士生导师1名，硕士生导师4名；高级职称9名；博士8名，硕士16名，人才梯队完整。

在国际上率先开展胃镜辅助下梨状窝瘘切除以及改良Soave术治疗肛门直肠血管畸形；新生儿NEC总体生存率已达到欧美发达国家水平；在国内最早建立了小儿微创外科中心，通过微创手术治疗食道闭锁、复杂先天性直肠肛门畸形；并在国内率先开展腹腔镜+内镜“双镜联合手术”、3D腹腔镜、腹腔镜后腹膜肿瘤切除、单孔腹腔镜手术以及ERCP等。“儿童实体瘤诊治中心”采用新技术、新理念对儿童实体肿瘤开展MDT模式诊治已10余年，并已在国内外具有较高的影响力，儿童实体恶性肿瘤5年存活率已接近国际一流水平；与复旦大学华山医院合作开展小儿肝脏移植手术，手术量居全国前列。

在不断推进临床工作高水平发展同时，大力推进基础科研建设，已获国家及省市课题20余项，累计科研经费达800余万元；近5年发表论文100余篇，其中SCI 50余篇。并获发明专利5项。